医学信息学院党总支成立于2011年，现由三个支部构成：教工一支部（医学信息学院教工党支部）、教工二支部（现代教育技术中心教工党支部）和学生党支部。党总支共有中共党员54人，其中正式党员46人，预备党员8人。

医学信息学院党总支依据学院的发展规划——“立足江苏、辐射全国，服务地方和社会发展，服务医疗卫生行业发展”和培养定位——“走理工医结合之路、培养国家需要的医学领域复合型高级工程技术人才”，充分发挥政治核心作用，保证了党的路线、方针、政策及党委下达的任务在医学信息学院的贯彻和落实。